Here is a list of all struct and union fields with links to the structures/unions they belong to:

- c -

• c : bm::pad60_struct
• cache_gap_block() : bm::aggregator< BV >
• calc_effective_rows_not_null() : bm::basic_bmatrix< BV >
• calc_octet_stat() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• calc_prefix_sum() : bm::bvps_addr_resolver< BV >
• calc_stat() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::basic_bmatrix< BV >, bm::bvector< Alloc >, bm::compressed_buffer_collection< BV >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• calculate() : bm::similarity_batch< SDESCR >
• capacity() : bm::sparse_vector_serial_layout< SV >
• carry_overs : bm::aggregator< BV >::arena
• chain_size : bm::block_match_chain< BLOCK_IDX >
• check_create_target() : bm::aggregator< BV >
• check_or_next() : bm::bvector< Alloc >
• check_or_next_extract() : bm::bvector< Alloc >
• chrono_taker() : bm::chrono_taker< TOut >
• CKMerAcc() : CKMerAcc
• clear() : bm::bvector< Alloc >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• clear_all() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• clear_bit() : bm::bvector< Alloc >, bm::bvector_mini< A >
• clear_bit_no_check() : bm::bvector< Alloc >
• clear_column() : bm::basic_bmatrix< BV >
• clear_empty_groups() : CSeqClusters
• clear_member() : CSeqGroup
• clear_range() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::bvector< Alloc >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• clear_range_no_check() : bm::bvector< Alloc >
• clear_row() : bm::basic_bmatrix< BV >
• clear_slices_range() : bm::basic_bmatrix< BV >
• clear_value_planes_from() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >
• clear_xor_compression() : bm::sparse_vector_deserializer< SV >
• cnt : bit_visitor_functor, bm::bvector< Alloc >::iterator_base::bitblock_descr
• cnt_vect_ : bm::aggregator< BV >::pipeline_bcache
• code : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >
• cols() : bm::tmatrix< T, ROWS, COLS >
• combine_and() : bm::aggregator< BV >, bm::bvector_mini< A >
• combine_and_horizontal() : bm::aggregator< BV >
• combine_and_sub() : bm::aggregator< BV >
• combine_and_sub_bi() : bm::aggregator< BV >
• combine_and_sub_horizontal() : bm::aggregator< BV >
• combine_operation() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_and() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_block_and() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_block_and_or() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_block_or() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_block_sub() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_block_xor() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_or() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_sub() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_with_block() : bm::bvector< Alloc >
• combine_operation_xor() : bm::bvector< Alloc >
• combine_or() : bm::aggregator< BV >, bm::bvector_mini< A >
• combine_or_horizontal() : bm::aggregator< BV >
• combine_shift_right_and() : bm::aggregator< BV >
• combine_sub() : bm::bvector_mini< A >
• combine_xor() : bm::bvector_mini< A >
• common_prefix_length() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >, bm::sv_sample_index< SV >
• compare() : bm::bvector< Alloc >, bm::bvector_mini< A >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• compare_nomap() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• compare_octet() : bm::basic_bmatrix< BV >
• compare_remap() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• compare_state() : bm::bvector< Alloc >::iterator_base
• compare_str() : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• complete() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >, bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >::pipeline< Opt >
• compress() : bm::rank_compressor< BV >
• compress_by_source() : bm::rank_compressor< BV >
• compressed_collection() : bm::compressed_collection< Value, BV >
• compressed_collection_type : bm::compressed_collection_deserializer< CBC >, bm::compressed_collection_serializer< CBC >
• compression_level_ : bm::sv_serialization_plan_builder< SV >::serialization_params
• compute_avg_count() : CSeqClusters
• compute_distance_matrix() : bm::gap_transpose_engine< GT, BT, BLOCK_SIZE >
• compute_run_batch() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• compute_s_block_stats() : bm::xor_scanner< BV >
• compute_sim_model() : bm::serializer< BV >, bm::sparse_vector_serializer< SV >, bm::xor_scanner< BV >
• compute_xor_complexity_descr() : bm::xor_scanner< BV >
• const_iterator() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >::const_iterator, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::sparse_vector< Val, BV >::const_iterator, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::const_iterator
• const_reference : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::bvector< Alloc >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::const_reference
• construct() : bm::sv_sample_index< SV >
• construct_arena() : bm::aggregator< BV >
• construct_arg_group() : bm::aggregator< BV >
• construct_bvector() : bm::basic_bmatrix< BV >
• construct_row() : bm::basic_bmatrix< BV >
• construct_rs_index() : bm::bvps_addr_resolver< BV >
• container() : bm::compressed_collection< Value, BV >
• container_type : bm::compressed_collection< Value, BV >, bm::compressed_collection_deserializer< CBC >
• copy() : bm::bvector< Alloc >
• copy_from() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::basic_bmatrix< BV >
• copy_range() : bm::bvector< Alloc >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• copy_range_no_check() : bm::bvector< Alloc >
• copy_range_slices() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >
• copy_to_array_functor() : bm::copy_to_array_functor< B >
• correct_nulls() : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >
• count() : bm::aggregator< BV >, bm::bvector< Alloc >, bm::bvector< Alloc >::counted_enumerator
• count_and_union_sync() : CSeqGroup
• count_blocks() : bm::bvector< Alloc >
• count_range() : bm::bvector< Alloc >
• count_range_no_check() : bm::bvector< Alloc >
• count_range_notnull() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• count_res_vect_ : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• count_to() : bm::bvector< Alloc >
• count_to_test() : bm::bvector< Alloc >
• count_vector_type : bm::aggregator< BV >
• counted_enumerator() : bm::bvector< Alloc >::counted_enumerator
• Counting_JobFunctor() : Counting_JobFunctor< DNA_Scan >
• CSeqClusters() : CSeqClusters, CSeqGroup
• CSeqGroup() : CSeqGroup
• CSequenceColl() : CSequenceColl
• csv1 : sample_data_frame
• csv2 : sample_data_frame
• csv3 : sample_data_frame
• ct_all : bm::chrono_taker< TOut >
• ct_ops_per_sec : bm::chrono_taker< TOut >
• ct_time : bm::chrono_taker< TOut >
• cvalue : bm::bit_decode_cache